В игре Pro Evolution Soccer 2011 3D для Nintendo 3DS представлено более 60 национальных сборных и 170 клубов. Также в игре представлена Лига Чемпионов, Мастер Лига, и возможность играть вдвоем по беспроводной сети.
Кроме всего этого в Pro Evolution Soccer 2011 3D реализован режим Street Pass. Если его включить и пройти рядом с человеком, у которого на 3DS также активен этот режим, консоли автоматически возьмут данные из Мастер Лиги, и на основании сил команд будет определен победитель. Если будете получать много побед, то через некоторое время откроются дополнительные игроки и команды.