У самурая нет цели — есть только путь. Пройдите путем самурая в японскую Смуту — период Сэнгоку — и оставьте свой след в истории. Кровавый или благородный — зависит от вас. Знаменитая серия, славная невероятной свободой, предоставленной игроку, возвращается с новыми возможностями, графикой и механикой, которые понравятся старым поклонникам и увлекут людей, еще не знакомых с путем самурая. Действие игры происходит в феодальной Японии в Период Сенгоку. Главный герой - бродячий ронин, который прибывает в маленькой провинции Gishu Amana, которая находится под властью клана Фьюджимори. Противостоит им партия Ука, которые ранее в числе самураев клана Сакурай, которые ранее властвовали в этой провинции. Они хотят вернуть себе власть в провинции. Третья сторона - жители деревни Косшу, страдающие из-за высоких налогов. Как и в предыдущих частях в Way of the Samurai 3 свободный геимплей и концовка зависит от действий игрока.