История начинается с того, что ребенок-вундеркинд Сората Судзухара заблудился, услышав таинственную песню, и потерял сознание. Когда он приходит в себя, то обнаруживает, что перенесся в прошлое. В этом незнакомом и странном месте он вскоре встречает девушку, которая сообщает ему, что он пропустил время, и вскоре обещает помочь ему вернуться домой. Сората следует за таинственной девушкой на круглый дирижабль под названием "Норн", который летает с помощью технологии, превосходящей его воображение. На этом корабле он встречает трех девушек и девять юношей, обладающих уникальными способностями, которые отправляются в путешествие, данное им человеком по имени "Мир".

Раскройте тайны корабля и его обитателей с точки зрения каждой из трех девушек, общайтесь с другими персонажами и смотрите, как они реагируют на те или иные ситуации. Переживайте путешествие и развивающийся сюжет, поскольку игроки решают судьбу персонажей в разветвленной сюжетной линии. Пройдите игру несколько раз, чтобы разгадать истинную концовку истории, что добавляет значительную ценность повторному прохождению. Переживите радостные моменты Norn9: Var Commons в режиме галереи, участвуйте в игровых квестах и собирайте очки, чтобы разблокировать другие бонусы и специальные возможности.