В один прекрасный день «злые» силы похищают Микки Мауса из его привычного доброго и цветастого мирка и помещают в мрачную и темную «Мультяшную Пустошь» (Cartoon Wasteland), откуда известному мышонку предстоит сбежать и вернуться домой. По пути он повстречает многих старых и забытых всеми персонажей мультфильмов во главе с кроликом Освальдом – первым мультгероем Уолта Диснея, которого в тридцатые годы прошлого века заменил Микки. О нем все забыли и теперь он каждым контуром своего черно-белого тела ненавидит своего популярного преемника.

Помимо стандартных прыжковых упражнений Epic Mickey предложит диковинную штучку – возможность собственноручно дорисовывать или стирать части уровня, дабы продвинуться вперед. От ваших действий по облагораживанию мира будет зависеть и то, как мир будет относиться к Микки – если вы будете помогать всем и каждому, то вас будут воспринимать как спасителя. Ну, или как злодея – даже разить врагов тут можно по-разному, либо применяя силу и стирая бедняг, либо находя более мирные пути. Шутка ли, даже боссов можно одолеть, не применяя силу. Нелинейность и свобода выбора в Epic Mickey преобладают.